據臺灣“中央社”消息，市售轉基因食品標示約有9%不合格，6月1日有新規定，含有轉基因原料超過3%的包裝食品，必須強制標示;非轉基因食品，有條件自愿標示不含轉基因物質。
臺“食藥署”指出，轉基因食品原料超過3%(原本為5%)，即視為轉基因食品原料，含轉基因物質的包裝食品、食品添加物自6月1日起必須如實標示，目前只允許轉基因黃豆、玉米上市，沒有謠傳的轉基因小麥、轉基因番茄等。
含有轉基因物質農產品型的黃豆粉、玉米谷粒，以及市場散裝豆腐、玉米粉、素肉等，強制標示轉基因食品實施日期分別為今年10月1日、明年1月1日。
至于標示“非轉基因”或“不是轉基因”的條件，食藥署解釋，當國外出現轉基因玉米、轉基因大豆、轉基因番茄等轉基因食品時，業者相對使用非轉基因的相同食品時，方可舉證及自愿標示非轉基因;相反地，當國際間都沒有某種轉基因食品時，業者不可宣稱非轉基因，以免令人混淆誤解有這種轉基因食物。
臺食藥署聯合衛生機關去年對314件市售包裝食品進行轉基因標示符合性抽驗，經檢驗后計有288件產品標示符合規定，標示符合規定比率為91.7%。不合格部分，4件產品標示不完全符合規定，22件產品標示不符合規定(標示誤導10件、應標示而未標示5件及標示錯誤7件)。
